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qpcr数据分析 |
qpcr数据处理公式,pcr结果的统计学分析
2-△△CT方法可用于定量PCR实验来计算基因表达的相对变化:2-△△CT公式的推导,以及实验设计,有效性评估在AppliedBiosystemsUserBulletinNo.2(P/N4303859)中有介绍。用2-△△C很简单,对上面推导得到的所有样本和control组的2^(-△Ct),均除以control组的2^(-△Ct),即可得到2^(-△△Ct);好,到这里,就明白了qPCR数据分析中△△Ct法的计算原理及推导过程。【实
在「我的页」左上角打开扫一扫其他扫码方式:微信下载知乎App 开通机构号无障碍模式验证码登录密码登录获取短信验证码获取语音验证码登录/注册其他方式登录未注册手机验证后自动登录,注最最最常用的qPCR相对定量的方法是ΔΔCT 法(读作:delta delta CT) 公式如下ΔCT = CT(target gene)−CT(reference gene). ΔΔCT = ΔCT(target sample)−ΔCT(reference
具体的计算公式为:△Ct= Ct(目的基因)- Ct(内参基因)△△?Ct=?△Ct(实验组)-?△Ct(对照组) RQ=2^-△△Ct 假设上面研究光诱导对拟南芥AtSUC2基因表达影响的实验荧光定量PCR是一种相对表达定量的方法,他的计算方法有很多,常用的相对定量数据分析方法有双标曲线法,ΔCt法,2^-ΔΔCt法(Livak法),用参照基因的ΔCt法和Pfaffl法。这里主要讲解常用
∩^∩ qpcr是个简单不失严谨的实验大量操作价格也不低因此小伙伴们初次进行或者更换厂家试剂盒时不妨通过预实验熟悉试剂盒说明书和操作细节以免大量操作结果无法掌握且耗时耗力qPC使用瞎编数据,for example:与对照(CG)相比,线虫liver处理的X基因的相对表达量,数据前处理得出相对表达量,然后用graphpad进行绘图。1、从仪器中导出的qPCR数据,从数据中找到result。
˙▂˙ 图1. 典型qPCR 实验所需的严格的数据处理流程当样品数量过多时不可避免会碰到多板数据合并的情况,要引入内部校正因子来尽量消除批次效应带来的误差。目前很多实验室习惯于使用E1、整理qPCR数据如下。Sample为模板名称,595为引物扩增的基因名称,actin为内参。2、计算ΔCt。ΔCt=基因值-内参值。3、计算均值。以野生型SY4D表达量为1,只需计算SY4D均值。4、
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